昆明经开区位于昆明市公路交通枢纽位置，昆石（至石林）、昆玉（至玉溪）、贵昆路（至贵阳）、昆洛路等高速路及国道穿区而过，是连接滇西、滇东、滇南以及省外和国外的重要交通枢纽位置。距昆明市区4公里。从昆明沿公路可直接抵达中（国）老（挝）边境磨憨口岸（国家一级口岸）、中（国）越（南）边境河口口岸（国家一级口岸）、中（国）缅（甸）瑞丽口岸（国家一级口岸）。以昆明为中心的200公里半径范围内的公路，全部实现了高等级化。
铁路
云南省形成以昆明为中心的铁路网，主要有贵昆铁路、成昆铁路、南昆铁路、昆大铁路、滇越铁路等铁路干线。开发区距昆明两大铁路客货枢纽中心－昆明南站4公里，昆明东站2公里。
南昆铁路（南宁－昆明）、昆河铁路（昆明至河口）穿区而过。
昆明东部铁路货运站（昆明铁路货运中心）距我区5公里；王家营铁路货运站和正在规划建设中的呈贡王家营国际物流中心距我区信息产业基地5公里。
航空
昆明国际机场为中国重要国际机场之一。开通直航香港、澳门、新加坡、仰光、吉隆坡、汉城、大阪等国际（地区）航线8条，国内航线70多条，开发区距离昆明国际机场仅1.8公里。规划中的新机场距我区15公里。
云南省湄公河水运已具备开航条件，货物可通过水路运到东盟五国。为沿岸地区输出当地产品和输入外地商品的交通动脉，起着产品集散作用。
港口
经南昆铁路，从广西的北海港或防城港出海，经贵昆铁路，至广东湛江港出海，也可至上海港出海或经滇越铁路至越南海防港出海。
五百公里经济圈
根据经济学五百公里经济圈理论，经开区所处地域的覆盖范围不但有云南、四川、贵州、广西、湖南，同时还包含了越南、泰国、老挝、缅甸、柬埔寨。扩大了企业的发展空间，采购及销售范围。